Una vez el virus se fusiona, introduce al interior de la célula su RNA que lleva toda su información y mediante una enzima -compuesto químico- que posee llamada transcriptasa inversa, "transcribe" su RNA y lo convierte en DNA viral, de esta forma podríamos decir que el virus se "disfraza" de DNA similar al de la célula para pasar desapercibido.
Existen medicamentos inhibidores de la transcriptasa inversa de dos tipos: nucleósidos y no nucleosidos que bloquean este paso en la replicación del virus.